Text
SKRIPSI STUDI POLIMORFISME GEN LEPR PADA DOMBA, KAMBING, DAN SAPI BERDASARKAN DATABASE GEN BANK
INTISARI
STUDI POLIMORFISME GEN LEPR PADA DOMBA, KAMBING, DAN SAPI BERDASARKAN DATABASE GEN BANK
Shinta Dwi Pramesti
shintadwiip@gmail.com
Domba memiliki morfologi yang mirip dengan kambing dari pada dengan sapi. Persamaan dan perbedaan morfologi antara ketiga spesies tersebut tidak selalau diikuti dengan perbedaan dan persamaan fenotip sifat reproduksinya. Oleh karena itu, sifat reproduksi antar ketiganya perlu dikaji pada level genetik. Gen LEPR adalah kandidat kuat gen pengaturan sifat reproduksi. Penelitian ini bertujuan membandingkan profil gen LEPR antara domba, kambing dan sapi. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah analisis statistik deskriptif secara induktif. Profiling dilakukan menggunakan program BLAST (local alignment dan global alignment) dalam NCBI. Polimorfisme yang diperoleh kemudian dianalisis jenis mutasinya. Melalui global alignment diperoleh hasil persentase kemiripan terbesar pada domba-sapi yaitu 95% sedangkan domba-kambing dan domba-sapi memiliki nillai 54% dan 53%. Melalui local alignment diketahui adanya perubahan SNP dan perubahan asam amino. Perubahan asam amino menghasilkan silent mutation, neutral mutation, dan missense mutation dengan proporsi yang berbeda. Berdasarkan hasil penelitian secara keseluruhan dapat disimpulkan bahwa gen LEPR antara ketiga spesies memiliki profil yang berbeda. Perbedaan tersebut dapat menegaskan mengapa domba, kambing, dan sapi memiliki perbedaan sifat reproduksi.
Kata kunci: alignment, BLAST, domba, kambing, gen LEPR, mutasi, sapi, sifat reproduksi, SNP.
40-UN57.U1-SPT-VII-2024 | PETERNAKAN PRA S 2024 | Ruang Skripsi (PETERNAKAN) | Tersedia namun tidak untuk dipinjamkan - No Loan |
Tidak tersedia versi lain