Text
SKRIPSI ANALISIS POLIMORFISME GEN BMPR-1B PADA EKSON 8 DAN HUBUNGANNYA DENGAN SIFAT PROLIFIK PADA KAMBING KALIGESING
ABSTRAK
NADHIA KHANSA. Analisis Polimorfisme Gen BMPR-1B Pada Ekson 8 dan Hubungannya dengan Sifat Prolifik Pada Kambing Kaligesing. Dibimbing oleh GALY HARDYTA dan AYU RAHAYU
Kambing Kaligesing merupakan plasma nutfah lokal dengan potensi reproduksi yang baik. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi variasi genetik gen BMPR-1B pada ekson 8 dan hubungannya dengan litter size pada kambing Kaligesing. Sebanyak 10 kambing Kaligesing betina, terdiri atas 5 prolifik dan 5 nonprolifik, diamati untuk karakter reproduksi dan morfometrik. DNA genom diisolasi dari darah vena jugularis, diamplifikasi menggunakan PCR (140 bp), kemudian dilakukan sekuensing dan analisis menggunakan BioEdit, Clustal Omega, dan PopGene. Penjajaran sekuens terhadap referensi GenBank NM_001285575.1 menunjukkan adanya substitusi c.907G>C; namun, seluruh individu bergenotipe CC, dengan frekuensi alel C = 1,00 dan G = 0,00, sehingga lokus tersebut bersifat monomorfik. Substitusi tersebut mengubah kodon CGG menjadi CCG dan berimplikasi pada perubahan asam amino arginin menjadi prolin. Substitusi pada ekson 8 gen BMPR-1B ini tidak menunjukkan hubungan dengan perbedaan litter size pada populasi sampel yang diamati. Analisis korelasi menunjukkan bahwa bobot badan berhubungan positif sangat nyata dengan litter size (r = 0,873; P < 0,01), sedangkan lebar pinggul berhubungan negatif sangat nyata (r = -0,901; P < 0,01). Lingkar dada menunjukkan korelasi positif tetapi tidak signifikan (r = 0,577; P = 0,081), sedangkan tinggi pundak dan panjang badan tidak berhubungan signifikan dengan litter size (P > 0,05).
Kata kunci: BMPR-1B, kambing Kaligesing, ekson 8, prolifik, litter size
Tidak tersedia versi lain