Text
SKRIPSI STUDI POLIMORFISME GEN KISS1 INTRON 1 PADA DOMBA PERSILANGAN MERINO GARUT (MEGA) DAN DOMBA CROSS TEXEL
ABSTRAK
SUSILA RUDY ATMAKA. Studi Polimorfisme Gen KiSS1 Intron 1 pada Domba Persilangan Merino Garut (MEGA) dan Domba Cross Texel. Dibimbing oleh AYU RAHAYU dan GALY HARDYTA
Domba persilangan Merino Garut (MEGA) dan domba Cross Texel merupakan domba hasil persilangan yang memiliki potensi produksi dan produktivitas yang baik. Salah satu gen kandidat yang berperan dalam regulasi reproduksi adalah gen KiSS1 yang dilaporkan berasosiasi dengan sifat prolifik pada ruminansia kecil. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi polimorfisme Single Nucleotide Polymorphism (SNP) pada gen KiSS1 intron 1 serta menganalisis keragaman genetik berdasarkan frekuensi alel, frekuensi genotipe, dan keseimbangan Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE). Penelitian dilakukan pada enam sampel darah domba betina non-prolifik yang terdiri atas tiga domba MEGA dan tiga domba Cross Texel. Analisis meliputi isolasi DNA, amplifikasi DNA menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR), elektroforesis gel agarosa, sekuensing DNA metode Sanger, penjajaran sekuens, identifikasi SNP, dan analisis keragaman genetik. Hasil penelitian menunjukkan adanya sembilan SNP pada fragmen gen KiSS1 intron 1, yaitu 38T>C, 59A>T, 65T>A, 147T>C, 172G>A, 271C>T, 272G>C, 279T>C, dan 312C>T. Sebagian besar lokus bersifat monomorfik, sedangkan SNP 147T>C bersifat polimorfik dengan frekuensi genotipe heterozigot sebesar 0,167 dan homozigot dominan sebesar 0,833. Frekuensi alel minor pada lokus tersebut sebesar 0,083 dan analisis HWE menunjukkan populasi berada dalam keseimbangan genetik. Temuan ini memberikan informasi awal mengenai variasi genetik gen KiSS1 pada domba persilangan MEGA dan Cross Texel.
Kata kunci: domba Cross Texel, domba MEGA, keragaman genetik, KiSS1, SNP
Tidak tersedia versi lain